
Satuan Kerja di lingkungan Kantor Kementerian Agama Kota Madiun berjumlah 6, yang terdiri dari : Kantor Kementerian Agama, Madrasah Aliyah Negeri (MAN), Madrasah Tsanawiyah Negeri (MTsN) dan Madrasah Ibtidaiyah Negeri (MIN). Sementara itu Kantor Urusan Agama (KUA) Kecamatan merupakan unit kerja yang berada di bawah satuan kerja Kantor Kementerian Agama.